2017年，中国兽医药品监察所分别赴全国31个省、自治区、直辖市及新疆生产建设兵团开展调研，全面了解兽药电子追溯系统使用情况。根据调研结果，组织相关部门详细梳理分析兽药追溯中存在的问题及用户需求，编制了详尽的使用需求说明书和技术需求说明书。新系统建设仅用3个多月时间，历经6个阶段，于2017年12月1日正式上线。新系统完善了兽药管理模块、基础信息模块、兽药生产企业模块、兽药经营企业模块、APP应用模块和相关接口等6个模块，为推进兽药追溯工作提供有力的技术支撑。
在农业部兽医局指导下，各省级兽药管理部门密切配合，中监所在系统升级重构后仅用时2周成功实现新系统与11个省级系统对接，2017年底完成全国经营企业注册34050家，占全国经营企业总数63%，超额完成经营环节推广应用的年度目标。积极发挥兽药产品追溯系统作用，完成青岛市和吉林省“先打后补”试点工作对接。截至目前，1710家生产企业注册使用新系统，用户共申请码34.9亿个，经营企业注册36183家，监管单位注册1452家，历史数据迁移128万单，系统功能稳定，性能良好，得到了企业和监管单位等用户的一致好评。
